Pokémon Mundo Misterioso: Exploradores del Tiempo y Exploradores de la Oscuridad (Pokémon Mystery Dungeon: Explorers of Time & Explorers Of Darkness en inglés) son dos versiones de un juego de Pokémon de género RPG basado en los juegos clásicos de mazmorras pero ambientado en el mundo Pokémon y con sus personajes. Forma parte de la Saga Pokémon Mundo Misterioso y es la segunda parte del original Pokémon Mundo Misterioso: Equipo de rescate Rojo y Equipo de rescate Azul.

Historia:

Despiertas por los gritos de un Pokémon, que te ha encontrado tirado en una playa, y descubres que te has convertido en un Pokémon. Desconcertado por los hechos y sin saber el motivo de tu transformación, decides hacerte amigo de ese Pokémon que acabas de conocer y del que no te separarás durante el resto de la historia.

Después de ayudarle a recuperar el amuleto que le acaban de robar, el Pokémon, te propone formar junto a él un equipo de exploración Pokémon. Para ello os dirigís al Pokégremio, lugar donde se entrenan y organizan los equipos de exploración, donde os aceptan y empezáis a participar en misiones de rescate por los diferentes territorios mientras intentas descubrir qué ocurrió para que te convirtieras en Pokémon.

Descubrirás que hay un Pokémon que ha vuelto al pasado para robar los engranajes del tiempo, para que el tiempo se detenga y el mundo quede sumido en una eterna oscuridad. Y tú serás el encargado de detenerle.

Tras gana la batalla contra el supuesto enemigo final y ver los créditos el juego continuará, si bien la primera parte trata del descontrol del tiempo la segunda trata de la distorsión del espacio, con un final inesperado que acabara por desvelar la verdadera razón por la cual el tiempo estaba descontrolado y porque te convertiste en un Pokemon.

El juego cuenta con una tercera parte a la que solo se puede acceder por Carta Secreta. Esta parte trata sobre la búsqueda de los siete tesoros, los cuales son:

• Flauta Hielo: 4MP= K98# CT%Y R@-- &P7% %K86(jefe articuno)
• Herbicorneta: X%8S WYY+ S-JF PFH@ @##K 5W8K(jefe mew)
• Acuamónica: FN01 HWN- 00%F 8678 +XY@ &%#3(jefe kyogre)
• Terracímbalo: #&S6 NY2& YJN= 1P57 F0MN MH7Y(jefe groudon)
• Aeromelódica: HW+8 66%T 5S51 +J5Y 4-K# H@P-(jefe rayquaza)
• Tambor Fuego: FH0T HYNH R0QF 86N8 +SY@ &%YN(jefe heatran)
• Cuerno Roca: WNWY JXTK &5C1 4N3- P4NM 8K&C(jefe giratina)

Estos son los códigos de cartas secretas. Desbloquearán la mazmorra donde tendremos que derrotar a un jefe final (Pokémon legendario) y que soltará el objeto al derrotarlo. Estos objetos sirven para facilitar el reclutar los Pokémon de cierto tipo dependiendo del objeto.